273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4168 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  48.82 
 
 		 819 aa  651    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  50.12 
 
 		 799 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4168  Male sterility domain  100 
 
 		 764 aa  1521    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4170  HAD family hydrolase  49.48 
 
 		 787 aa  624  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243579  normal  0.356217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.79 
 
 		 768 aa  537  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19450  phosphoserine phosphatase  43.32 
 
 		 778 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 750 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1432  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.13 
 
 		 770 aa  379  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.438652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 1542 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2220  hypothetical protein  28.9 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.7 
 
 		 1537 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 1557 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 1538 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 1538 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3628  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.48 
 
 		 232 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  hitchhiker  0.00143877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1214  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 225 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.77 
 
 		 225 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.77 
 
 		 225 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1167  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 225 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0481  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  30.94 
 
 		 218 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1925  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.25 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.04 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  40.79 
 
 		 354 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.18 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  32.94 
 
 		 220 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6135  HAD family hydrolase  29.82 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  28.37 
 
 		 1560 aa  70.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.11 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.92 
 
 		 493 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  33.67 
 
 		 437 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.76 
 
 		 311 aa  69.7  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 217 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3299  HAD family hydrolase  30.51 
 
 		 272 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4355  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.39 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.36 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  29.24 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2740  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.5 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.22 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.43 
 
 		 218 aa  67  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 228 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.94 
 
 		 272 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  29.83 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.83 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.84 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6034  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.47 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  33.11 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  35.1 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  31.51 
 
 		 193 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  26.34 
 
 		 207 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0418  HAD family hydrolase  31.18 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4446  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.6 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.56 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  30.23 
 
 		 374 aa  62  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 228 aa  62  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30 
 
 		 937 aa  62  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  29.96 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2564  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341145  normal  0.242767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.92 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02790  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.82 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  30 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3004  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886129  normal  0.404374 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.63 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 1406 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.41 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.25 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  36.8 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  36.51 
 
 		 218 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  28.09 
 
 		 226 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.24 
 
 		 275 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  23.28 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  33.09 
 
 		 289 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  30.49 
 
 		 227 aa  60.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3285  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 249 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 		 369 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  32.59 
 
 		 192 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  38.46 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  32.68 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0069  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 295 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0248353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>