More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5286 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  94.47 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  80.28 
 
 		 218 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  75.58 
 
 		 217 aa  351  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  75.58 
 
 		 218 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  73.73 
 
 		 218 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  74.19 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  74.19 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  68.2 
 
 		 217 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  68.2 
 
 		 217 aa  320  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  67.74 
 
 		 217 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 218 aa  274  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  56.62 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  53.46 
 
 		 219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  56.16 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  53.64 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  53.67 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  56.31 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  56.31 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  53 
 
 		 228 aa  244  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  54.13 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  53.46 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  52.49 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  49.31 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  51.82 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  51.13 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  54.38 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  48.87 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  50.67 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  49.55 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  48.42 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  49.31 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  47.51 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  49.55 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0510  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  50.23 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.88 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1479  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  49.1 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.88 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.61 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  48.62 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  45.7 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  51.36 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  46.4 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  46.12 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.17 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  48.17 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  44.95 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  44.39 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  45 
 
 		 222 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  42.33 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  45.16 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4471  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  42.53 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.470983  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4605  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  42.53 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  43.06 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  44.29 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  44.7 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  42.33 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  42.33 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  43.19 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  42.13 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  46.58 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  43.19 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  39.17 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  39.63 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  38.25 
 
 		 216 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  40.62 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  41.18 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  34.74 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  39.63 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  39.72 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.45 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  38.8 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0833  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0756  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.453286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.45 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  32.39 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 285 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>