223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1764 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  100 
 
 		 226 aa  471  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1479  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  90.71 
 
 		 226 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  61.43 
 
 		 224 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  61.26 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  61.71 
 
 		 224 aa  291  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  57.78 
 
 		 228 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  57.33 
 
 		 225 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  56.44 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  56.44 
 
 		 225 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  59.46 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  56 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  56 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  56 
 
 		 225 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  55.11 
 
 		 225 aa  274  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  54.67 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  58.11 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  54.67 
 
 		 228 aa  268  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  54.67 
 
 		 228 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0510  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  51.57 
 
 		 227 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  52.02 
 
 		 227 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  52.44 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  53.85 
 
 		 220 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  50.45 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  52.47 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  52.47 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  52.91 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  51.8 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.87 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  49.77 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  50 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  47.98 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  49.1 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  50 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  50.44 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  49.55 
 
 		 218 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.96 
 
 		 219 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4605  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.22 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4471  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.22 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.470983  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  48.44 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  50 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  47.09 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  46.61 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  47.51 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.65 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.65 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  47.3 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  48.65 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  48.2 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  46.4 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  44.8 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  51.13 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  45.95 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  47.3 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  46.4 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  47.75 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  45.5 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  45.05 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  46.85 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  44.3 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  43.44 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2629  putative hydrolase protein  43.84 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  39.37 
 
 		 231 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  39.55 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.44 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  39.74 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  37.22 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  40.54 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  34.55 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  35 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  34.86 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  32.88 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  34.25 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  34.25 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 252 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  32.42 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  33.67 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1032  hypothetical protein  30.63 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  30.45 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0833  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0756  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.453286  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  28.31 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  33.79 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>