285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1721 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 217 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  99.54 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  96.31 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  95.39 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  76.04 
 
 		 217 aa  342  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  75.12 
 
 		 217 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  73.44 
 
 		 193 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  65.28 
 
 		 217 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  61.11 
 
 		 216 aa  274  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  59.72 
 
 		 217 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  59.26 
 
 		 217 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  59.38 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  45.16 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1032  hypothetical protein  42.99 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  42.33 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  42.33 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  45.37 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  44.19 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  45.37 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  40.93 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  39.35 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  43.98 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  41.86 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.93 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  40.28 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  39.07 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  38.79 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  40.93 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  44.65 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  43.32 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  42.66 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  43.32 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  43.32 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  42.29 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  41.47 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  38.43 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  38.18 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.5 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  37.16 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  36.24 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.47 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  38.18 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  38.18 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  37.96 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.53 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  34.25 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  36.87 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  35.62 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  42.01 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.49 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.49 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  33.03 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0833  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0756  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.453286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.57 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1479  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.42 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4471  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.16 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.470983  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4605  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.16 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0510  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.62 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  36.94 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  33.95 
 
 		 247 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>