227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4471 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4605  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4471  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.470983  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  52.47 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  52.47 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  52.91 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  51.12 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  51.11 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  51.11 
 
 		 228 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  48.44 
 
 		 228 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  50.89 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  48 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  48.89 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0510  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.21 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  46.22 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  48.21 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1479  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  45.78 
 
 		 226 aa  214  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  48.2 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.75 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  47.3 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  47.77 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  44.14 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  47.3 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  48.65 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.11 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  47.11 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  44.59 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  45.85 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  45.85 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  44.59 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  49.1 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  42.66 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  44.14 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  45.5 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  42.53 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  42.53 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  45.95 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  46.22 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  44.14 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  43.44 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  43.44 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  40.54 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  42.79 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  42.99 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  42.99 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  44.39 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  44.84 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  42.53 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  42.08 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  42.53 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  42.08 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  42.08 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  44.84 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  45.09 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  44.2 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  45.05 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2629  putative hydrolase protein  45 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  33.18 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  41.85 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  37.27 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  32.88 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  37.27 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  37.16 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.05 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  35.62 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  35.45 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  35 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  35.16 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.78 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  34.09 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1032  hypothetical protein  29.73 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0833  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0756  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.453286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>