More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5147 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  99.08 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  94.04 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  91.28 
 
 		 218 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  78.34 
 
 		 218 aa  359  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  73.73 
 
 		 218 aa  345  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  74.19 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  71.89 
 
 		 217 aa  328  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  68.2 
 
 		 217 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  67.28 
 
 		 217 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  64.06 
 
 		 217 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  57.53 
 
 		 221 aa  257  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  58.06 
 
 		 227 aa  256  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  57.34 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  56.76 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  56.76 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  55.76 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  55.05 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  54.09 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  52.07 
 
 		 242 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  52.29 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  50.92 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  52.25 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  50 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  49.08 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  55.05 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  50 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  48.43 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  49.55 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  47.09 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.73 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  48.42 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.98 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  45.95 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.98 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  47.53 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  45.5 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  45.05 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0510  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.96 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  45.05 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  46.61 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  46.15 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  45.5 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  45.95 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  45.98 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  47.49 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  45.05 
 
 		 226 aa  197  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  47.06 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  45.21 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  49.1 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1479  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  44.14 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.17 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  48.17 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  46.61 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  44.44 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  43.52 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  45 
 
 		 235 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4471  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  43.44 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.470983  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4605  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  43.44 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  43.84 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  44.29 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  40.55 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  41.47 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  41.47 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  39.07 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  34.1 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  36.41 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  39.46 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  41.07 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 252 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.55 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1032  hypothetical protein  31.13 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  31.94 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.98 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  31.92 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.58 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>