214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2510 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  67.86 
 
 		 235 aa  314  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  67.26 
 
 		 233 aa  310  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  68.58 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  65.92 
 
 		 247 aa  307  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  66.82 
 
 		 237 aa  298  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  66.37 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  66.37 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  58.22 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  54.42 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  53.98 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  53.1 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  53.98 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  53.1 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  52.23 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  52.23 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  52.44 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  52.23 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  52.23 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  52.23 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  51.79 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  52 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  51.34 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  51.79 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  50.89 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  48.44 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  53.36 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  49.11 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  52.89 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1479  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.43 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  49.56 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  45.54 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  45.98 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  45.98 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  44.39 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  43.95 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.56 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.56 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0510  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.9 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  45.54 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  45.98 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  45.78 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  43.95 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.49 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  46.43 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  45.09 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  45.09 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  45.33 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  44.89 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4605  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.22 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4471  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  46.22 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.470983  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  43.75 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  45.54 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  45.54 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  44.2 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  41.7 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  41.74 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  48.44 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  42.54 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  42.15 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  41.33 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  42.41 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  43.11 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  42.15 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  43.05 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  37.95 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  36.2 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  36.2 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  34.09 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  36.61 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  36.32 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  35.87 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  35.75 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  40.97 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  34.38 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  34.2 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  34.09 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  39.11 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2629  putative hydrolase protein  39.11 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0833  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467298  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0756  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.453286  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1032  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.78 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.13 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  34.02 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  30.8 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>