291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  100 
 
 		 265 aa  523  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  69.92 
 
 		 258 aa  359  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  67.84 
 
 		 289 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  69.78 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  66.53 
 
 		 275 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0054  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  62.06 
 
 		 281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  57.46 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  59.76 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  58.08 
 
 		 284 aa  295  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  62.56 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  62.56 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  62.56 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  62.05 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  62.95 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  56.27 
 
 		 280 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  61.61 
 
 		 307 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0515  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  54.98 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.589704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6363  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  54.89 
 
 		 272 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.499829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  55.04 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  54.83 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1925  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  47.22 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4644  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  41.18 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.08 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2740  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.49 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0418  HAD family hydrolase  36.93 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  37.9 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8329  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.87 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  38.43 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0438  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.08 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.88 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3299  HAD family hydrolase  32.33 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  35.05 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.41 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 218 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6135  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6738  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.92 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  33.8 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  32.87 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4355  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.84 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 228 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  33.91 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6219  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  35.45 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  31.8 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  32.42 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.7 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.68 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0667  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02790  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.61 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0674  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10516  phosphoserine phosphatase serB1  35.02 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0069  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0248353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0687  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3259  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.81 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  34.86 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  31.8 
 
 		 217 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  32.88 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0481  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.06 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4446  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.02 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  32.75 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  30.88 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  38.36 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  32.57 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6034  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.18 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1010  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.78 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.31 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.29 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.13 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  28.76 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  32.09 
 
 		 217 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  33.06 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0843  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163877  normal  0.772835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  30.18 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  42.52 
 
 		 192 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0490  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.18 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1214  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>