More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3829 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  41.88 
 
 
369 aa  258  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  39.88 
 
 
365 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  39.6 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  38.68 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.23 
 
 
667 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  29.69 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7117  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.39 
 
 
580 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0187299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  25.6 
 
 
618 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.59 
 
 
618 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  25.37 
 
 
618 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  25.53 
 
 
618 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  25.07 
 
 
618 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  25.23 
 
 
627 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  25.23 
 
 
627 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  25.53 
 
 
618 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  23.68 
 
 
617 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  23.68 
 
 
618 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  32.38 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
320 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  28.15 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  26.29 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 
1454 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  30 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  26.95 
 
 
671 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  25.4 
 
 
659 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  27.65 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  26.39 
 
 
1394 aa  70.5  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  23.95 
 
 
661 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  27.98 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.32 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.12 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  26.22 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
324 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.28 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.28 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  27.89 
 
 
1436 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  25.94 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.94 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.94 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.94 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.94 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  28.57 
 
 
1506 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  25.87 
 
 
653 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.09 
 
 
937 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  26.12 
 
 
642 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  25 
 
 
664 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.63 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.63 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  28.27 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  25.22 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  23.78 
 
 
701 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  25.54 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
319 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
329 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  25.81 
 
 
506 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
307 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 
665 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  25.71 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3364  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  29.63 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.93 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
668 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>