124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1225 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1225  peptide synthetase  100 
 
 		 382 aa  799    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289629  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 505 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 		 1454 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  31.5 
 
 		 1188 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  28.42 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  30.37 
 
 		 1188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  30.37 
 
 		 1188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  31.73 
 
 		 2199 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5457  ornithine acetyl transferase inhibitor  30.19 
 
 		 1149 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0126  amino acid adenylation:thioester reductase  30.82 
 
 		 1129 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.488136  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5011  amino acid adenylation:thioester reductase  30.19 
 
 		 1148 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116457 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  27.59 
 
 		 1421 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  29.14 
 
 		 1002 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2109  nonribosomal peptide synthetase  28.69 
 
 		 1145 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  29.85 
 
 		 4123 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  26.24 
 
 		 1394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  29.55 
 
 		 4122 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  29.85 
 
 		 4157 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  29.55 
 
 		 4580 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  29.55 
 
 		 4098 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  29.55 
 
 		 4101 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  29.43 
 
 		 1500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  30.24 
 
 		 997 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 523 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  29.55 
 
 		 4048 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  29.07 
 
 		 1485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  28.94 
 
 		 2107 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  29.63 
 
 		 1067 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.95 
 
 		 1487 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  31.71 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  27.32 
 
 		 995 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  31.71 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  29.26 
 
 		 1077 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  29.41 
 
 		 1506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  27.33 
 
 		 1409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  27.63 
 
 		 992 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 2376 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  26.78 
 
 		 1413 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  26.63 
 
 		 1270 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  29.38 
 
 		 1436 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  29.88 
 
 		 1449 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  27.02 
 
 		 1498 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1373  thioester reductase domain protein  28.66 
 
 		 1105 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  27.27 
 
 		 991 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  26.54 
 
 		 1193 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  26.21 
 
 		 1193 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 2374 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10297  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  27.95 
 
 		 1060 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  26.91 
 
 		 1194 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7636  AMP-dependent synthetase and ligase  25.96 
 
 		 1444 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  27.1 
 
 		 1367 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.1 
 
 		 809 aa  93.6  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.78 
 
 		 2439 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  27.39 
 
 		 2113 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.76 
 
 		 2054 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  27.19 
 
 		 2638 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 1162 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3148  thioester reductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 1165 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03495  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  29.05 
 
 		 1480 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2092  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 1406 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  28.86 
 
 		 1174 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1174 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  27.78 
 
 		 1408 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1174 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  29.33 
 
 		 2512 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00540  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  24.24 
 
 		 1048 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04827  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  24.29 
 
 		 1051 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  27.53 
 
 		 1168 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  26.36 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  25.9 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01680  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  22.87 
 
 		 1237 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.13 
 
 		 937 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10486  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  23.48 
 
 		 1052 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.303807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  24.36 
 
 		 1478 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.669 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01034  polyketide synthase, putative (JCVI)  24.11 
 
 		 2793 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.276801 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02064  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  26.04 
 
 		 1038 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  26.1 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  28.3 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02032  polyketide synthase, putative (JCVI)  25.81 
 
 		 2221 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0972795  normal  0.27819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2274  LtxA  29.31 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.518726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26.27 
 
 		 661 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03386  polyketide synthase, putative (JCVI)  25.16 
 
 		 2493 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00523  polyketide synthase, putative (JCVI)  24.13 
 
 		 2476 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657884  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  23.66 
 
 		 2387 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  25.68 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.11 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 2391 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 2391 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03230  polyketide synthase, putative (JCVI)  23.37 
 
 		 2193 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  24.9 
 
 		 7214 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  36.84 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  23.58 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  27.67 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 750 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02634  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204143  normal  0.624369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2616  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 904 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  24.79 
 
 		 653 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  23.13 
 
 		 1395 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.69 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  22.32 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>