50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2274 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  99.12 
 
 
1002 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2274  LtxA  100 
 
 
226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.518726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2142  LtxA  98.74 
 
 
159 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  62.84 
 
 
995 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  60.09 
 
 
997 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  60.68 
 
 
991 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  57.27 
 
 
992 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2143  amino acid adenylation:thioester reductase  92.86 
 
 
88 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  34.9 
 
 
2113 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  28.28 
 
 
505 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  30.82 
 
 
506 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  32.5 
 
 
1485 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  36.28 
 
 
1454 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  25.13 
 
 
1077 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  35.16 
 
 
1436 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  35.16 
 
 
1500 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  26.47 
 
 
4157 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  26.47 
 
 
4101 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  26.47 
 
 
4122 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  26.47 
 
 
4098 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  26.47 
 
 
4580 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  26.47 
 
 
4123 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  25.98 
 
 
4048 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.63 
 
 
2374 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  27.27 
 
 
1067 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  31.79 
 
 
1506 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  25.45 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  26.32 
 
 
1409 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  28.29 
 
 
2107 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1225  peptide synthetase  29.31 
 
 
382 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.289629  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  28.57 
 
 
1270 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  27.14 
 
 
2376 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396a  polyketide synthase  25.84 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37952  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02634  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 
359 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204143  normal  0.624369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  29.23 
 
 
1498 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  31.58 
 
 
398 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  31.58 
 
 
398 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.801599 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10297  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  26.95 
 
 
1060 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.366843 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  27.4 
 
 
1421 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  32.17 
 
 
1449 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  25.5 
 
 
1367 aa  51.6  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  25.9 
 
 
1394 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2109  nonribosomal peptide synthetase  30.46 
 
 
1145 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0126  amino acid adenylation:thioester reductase  28.21 
 
 
1129 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.488136  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  26.63 
 
 
2199 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3396  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.94 
 
 
809 aa  45.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  26.27 
 
 
1413 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4973  amino acid adenylation  28.78 
 
 
1188 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3187  amino acid adenylation domain-containing protein  28.78 
 
 
1188 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  28.78 
 
 
1188 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>