16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2142 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2142  LtxA  100 
 
 
159 aa  330  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2274  LtxA  98.74 
 
 
226 aa  328  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.518726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2086  linear gramicidin synthetase subunit D  97.48 
 
 
1002 aa  326  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3516  amino acid adenylation domain-containing protein  56.95 
 
 
995 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5388  amino acid adenylation domain-containing protein  52.98 
 
 
997 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82388  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11140  putative nonribosomal peptide synthetase  52.63 
 
 
991 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1023  amino acid adenylation domain-containing protein  51.32 
 
 
992 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  22.48 
 
 
1077 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  32.65 
 
 
2113 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  29.17 
 
 
506 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  26.35 
 
 
2374 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30 
 
 
505 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1396a  polyketide synthase  26.76 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  29.14 
 
 
1485 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  27.03 
 
 
2376 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  30.38 
 
 
1500 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>