More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3685 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  698    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 		 333 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  58.2 
 
 		 331 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  59.27 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  56.86 
 
 		 334 aa  341  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  55.73 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  55.52 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  58.9 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  58.54 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  56.62 
 
 		 328 aa  332  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  58.54 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.23 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  57.83 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  52.28 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  52.81 
 
 		 325 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  51.55 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  51.37 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  52.66 
 
 		 336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  52.96 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  51.06 
 
 		 336 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.9 
 
 		 350 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.96 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  50.65 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  56.6 
 
 		 305 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  50.16 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  52.29 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1657  short chain dehydrogenase  53.35 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0430692 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0028  short chain dehydrogenase  54.1 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4173  short chain dehydrogenase  54.11 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4417  short chain dehydrogenase  47.84 
 
 		 350 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.496663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 342 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 332 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 295 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 332 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.77 
 
 		 544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 404 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 		 441 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  36.84 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 		 441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 260 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>