More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0767 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 330 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.97 
 
 		 330 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.16 
 
 		 332 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.96 
 
 		 327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.64 
 
 		 328 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  67.52 
 
 		 544 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.05 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.9 
 
 		 335 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.14 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  48.62 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  46.58 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 		 441 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  46.6 
 
 		 441 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  45.63 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 		 299 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.6 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  49.83 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 267 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 264 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 295 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.47 
 
 		 264 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 296 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 264 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.99 
 
 		 238 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.1 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.1 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.1 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.1 
 
 		 264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  34.1 
 
 		 264 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.09 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.72 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.12 
 
 		 238 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.71 
 
 		 264 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 247 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 264 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>