More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3554 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  75.08 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  71.76 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  66.56 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  53.97 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  62.2 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  55.59 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  52.98 
 
 		 346 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  56.21 
 
 		 336 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  57.29 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  60.07 
 
 		 336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  53.31 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  53.24 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  58.06 
 
 		 305 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  57.09 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1657  short chain dehydrogenase  58.17 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0430692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  53.58 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  51.04 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  53.82 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0028  short chain dehydrogenase  58.98 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  54.1 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  51.19 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  51.76 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  54.7 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  54.7 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  52.23 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 		 323 aa  265  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4173  short chain dehydrogenase  53.24 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.52 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4417  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.496663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 339 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 295 aa  156  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 369 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.55 
 
 		 544 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  31.99 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  28.48 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.92 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.92 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.92 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.92 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.92 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>