More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6383 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 332 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  55.52 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.79 
 
 		 334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  53.4 
 
 		 335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  51.31 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  53.97 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  53.09 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  54.66 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  57 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  57.69 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  52.43 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  52.27 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  52.7 
 
 		 325 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  52.8 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  57.79 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  58.76 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  56.95 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  53.29 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  50.46 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  54.36 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  54.36 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 		 323 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4173  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  51.96 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4417  short chain dehydrogenase  47.12 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.496663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  49.85 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1657  short chain dehydrogenase  49.14 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0430692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0028  short chain dehydrogenase  49.14 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 295 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.13 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  30.79 
 
 		 544 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 		 442 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 		 441 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>