More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4611 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 356 aa  699    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.39 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.39 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.69 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  51.44 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  53.05 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  51.23 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  46.47 
 
 		 441 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 441 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 		 326 aa  258  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  48.11 
 
 		 544 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.17 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 		 442 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 		 332 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  46.71 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 267 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 314 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 339 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 245 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 248 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 264 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 245 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 245 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 295 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.67 
 
 		 264 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.94 
 
 		 236 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.67 
 
 		 264 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.67 
 
 		 264 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.67 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 247 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 244 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.74 
 
 		 238 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>