More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1489 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.77 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.05 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.7 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.42 
 
 		 332 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 		 336 aa  295  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.49 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.92 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.49 
 
 		 355 aa  280  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  51.56 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 		 337 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  48.94 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 		 369 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 342 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 342 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  50.34 
 
 		 343 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  50.34 
 
 		 343 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  50.34 
 
 		 343 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.13 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 295 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 		 341 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  35.05 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 442 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  34.49 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 355 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 327 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 441 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 441 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 441 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  33.56 
 
 		 345 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.2 
 
 		 544 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 332 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 248 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.56 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  36.4 
 
 		 237 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.17 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.78 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.78 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.78 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>