More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3200 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 341 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.68 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.21 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  43.77 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  43.45 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  43.45 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  39.72 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  40.18 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  40.25 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  39.19 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  40.6 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  40.6 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  40.6 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  42.12 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  40.79 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  38.69 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  38.33 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 332 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  37.38 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  42.06 
 
 		 544 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  38.83 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  39.58 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 258 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 264 aa  149  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>