More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1326 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 336 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.67 
 
 		 336 aa  564  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.67 
 
 		 336 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.29 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.05 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.05 
 
 		 334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.03 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.84 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.69 
 
 		 332 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.69 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  54.01 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.82 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 		 355 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.3 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  48.52 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  50.16 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  50.16 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  49.52 
 
 		 342 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  47.91 
 
 		 343 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  47.91 
 
 		 343 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  48.52 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  47.59 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  47.59 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  47.59 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  47.59 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 295 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 		 441 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 442 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  37.77 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  46.53 
 
 		 247 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  37.34 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 270 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  33.54 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 248 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 271 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  36.91 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.22 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>