More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5897 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  100 
 
 
328 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  85.36 
 
 
333 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  63.67 
 
 
337 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.61 
 
 
293 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
404 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  49.06 
 
 
441 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  48.61 
 
 
441 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  49.37 
 
 
441 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  49.03 
 
 
442 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
334 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 
334 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.78 
 
 
326 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.54 
 
 
356 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  52.45 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
327 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.73 
 
 
330 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.93 
 
 
332 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
330 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  44.66 
 
 
544 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
328 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 
334 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
336 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
336 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
342 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
342 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
261 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
342 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
342 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
339 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
342 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
336 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
342 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
277 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
341 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
336 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
336 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
355 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
336 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
343 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
343 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
343 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
267 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
334 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
305 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 
270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
264 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
337 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
231 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
231 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
339 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
269 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
238 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
369 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
366 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
238 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 
346 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
248 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
247 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
258 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
336 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
257 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.62 
 
 
241 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
245 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
290 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>