More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6867 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  84.45 
 
 
328 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  63.06 
 
 
337 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.96 
 
 
293 aa  358  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.21 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  49.24 
 
 
441 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  49.22 
 
 
441 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  50.65 
 
 
441 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  47.4 
 
 
442 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.74 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.4 
 
 
334 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.46 
 
 
356 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  51.37 
 
 
327 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.25 
 
 
330 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.1 
 
 
330 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.75 
 
 
332 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  45.63 
 
 
544 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
327 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
334 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
328 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
336 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
299 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
291 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
291 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
291 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
261 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
293 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
355 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
336 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
355 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
342 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
337 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 
342 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 
342 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
342 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
342 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
342 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
267 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
336 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  29.9 
 
 
339 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
326 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.46 
 
 
238 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 
238 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
305 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 
269 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
332 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 
270 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
347 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
239 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
239 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  27.01 
 
 
346 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.45 
 
 
241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
342 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
258 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
257 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.48 
 
 
236 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
264 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
247 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>