More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A3026 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  99.42 
 
 		 343 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  99.71 
 
 		 343 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  99.71 
 
 		 343 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  99.42 
 
 		 343 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  99.42 
 
 		 343 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  99.42 
 
 		 343 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  82.02 
 
 		 342 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  81.12 
 
 		 342 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  82.6 
 
 		 342 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  82.3 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  82.65 
 
 		 342 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  81.39 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  60.59 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.29 
 
 		 336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.56 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.75 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.13 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  50.34 
 
 		 296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.68 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.67 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.52 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.13 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.55 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  39.12 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  35.76 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  34.28 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  36.62 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  37.5 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 261 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 332 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  32.04 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  33.21 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.83 
 
 		 264 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.83 
 
 		 264 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.83 
 
 		 264 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>