More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3988 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 404 aa  800    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.28 
 
 		 334 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.5 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.34 
 
 		 356 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  55.59 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  56.49 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  56.03 
 
 		 337 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  50.29 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  52.04 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  51.57 
 
 		 442 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  51.1 
 
 		 441 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.47 
 
 		 330 aa  292  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.19 
 
 		 293 aa  285  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.41 
 
 		 327 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  49.54 
 
 		 544 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.42 
 
 		 332 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.65 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  54.2 
 
 		 327 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.11 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 277 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 		 332 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 261 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 295 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 337 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 343 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 269 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 		 327 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  43.39 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.81 
 
 		 257 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 264 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 260 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 264 aa  126  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.96 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.91 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 276 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 244 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 280 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 247 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>