More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4176 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  65.11 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  64.71 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  59.42 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  60.78 
 
 		 331 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  60.14 
 
 		 328 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  63.48 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  54.89 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  56.76 
 
 		 335 aa  328  7e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  56.61 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  55.25 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  57.38 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  54.39 
 
 		 325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  58.82 
 
 		 336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  58.48 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1657  short chain dehydrogenase  56.87 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0430692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.76 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0028  short chain dehydrogenase  58.98 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  57.88 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  52.17 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  55.63 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  59.93 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  57.53 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  57.68 
 
 		 327 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.64 
 
 		 334 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  52.2 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  52.22 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  51.55 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  54.88 
 
 		 371 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  53.54 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 		 350 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4173  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 		 335 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 		 344 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4417  short chain dehydrogenase  47.5 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.496663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 295 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 369 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.4 
 
 		 544 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 		 441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 272 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 264 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 		 442 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>