More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2310 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  748    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  61.31 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  54.88 
 
 		 331 aa  319  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  58.33 
 
 		 328 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  59.25 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  55.12 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  58.9 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  50.46 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  56.82 
 
 		 327 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  51.85 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  50.15 
 
 		 336 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  53.59 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  54.48 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  52.07 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  51.02 
 
 		 334 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  56.07 
 
 		 345 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 336 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 		 323 aa  295  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  49.85 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.85 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  52.14 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1657  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0430692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  53.47 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0028  short chain dehydrogenase  56.11 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  55.64 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  54.9 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.64 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4173  short chain dehydrogenase  56.83 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 336 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4417  short chain dehydrogenase  47.27 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.496663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 355 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 334 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 295 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  33.12 
 
 		 441 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 336 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 332 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  31.79 
 
 		 441 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.9 
 
 		 544 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 261 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  34.11 
 
 		 301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  34.48 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 264 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>