More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0510 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
355 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
327 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  38.96 
 
 
544 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
334 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
330 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
330 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
336 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
336 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
334 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
332 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  36.45 
 
 
441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
336 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
334 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
332 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
441 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
336 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
334 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
342 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
326 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
343 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
442 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
336 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
404 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
341 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 
342 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
342 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
342 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
337 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 
333 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
246 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
246 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  35.85 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
337 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
252 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 
328 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
355 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
326 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
356 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
247 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 
326 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  40.49 
 
 
252 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
332 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
369 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
293 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  39.47 
 
 
247 aa  133  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
332 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 
339 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
247 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
248 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
248 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 
327 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
248 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
295 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
240 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
245 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
317 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
245 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
241 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
248 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
245 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 
327 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
333 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
261 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
244 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
331 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
331 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
253 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>