More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2845 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2845  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 305 aa  603  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.484563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  98.03 
 
 		 336 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  94.1 
 
 		 336 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  58.78 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  55.76 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  53.9 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  56.6 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  59.93 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  53.36 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  52.35 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  53.02 
 
 		 337 aa  291  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  53.5 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  55.48 
 
 		 336 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  56.12 
 
 		 327 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4417  short chain dehydrogenase  54.8 
 
 		 350 aa  279  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.496663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0420  short chain dehydrogenase  57.46 
 
 		 331 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  55.76 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  58.02 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  51.64 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  53.51 
 
 		 371 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  49.48 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.17 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  53.87 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4173  short chain dehydrogenase  54.26 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  51.94 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2182  short chain dehydrogenase  53.11 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1657  short chain dehydrogenase  53.98 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0430692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.5 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0028  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0855906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  34.53 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 		 355 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.92 
 
 		 544 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 404 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 442 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 671 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  28.76 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 441 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>