More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4107 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  100 
 
 		 269 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  47.66 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  45.67 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  48.03 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.8 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  41.11 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.4 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.02 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.35 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  35.06 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  35.55 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  39.39 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  36.8 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  31.42 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  34.6 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  35.93 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  34.39 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  33.48 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  36.74 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  32.88 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  32.88 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  32.32 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  33.94 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  33.48 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  34.21 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  33.19 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  35.09 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  34.65 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 308 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  30.8 
 
 		 267 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  35.02 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  31.96 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  32.88 
 
 		 251 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  28.23 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  34.84 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.87 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  32.42 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  33.33 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  33.33 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.16 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  28.51 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  32.88 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  33.93 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.47 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 482 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  35.24 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  35.24 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  33.64 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.4 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  34.68 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  32.47 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  32.6 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.53 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.72 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  29.2 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.6 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  29.5 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  29.96 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  34.64 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  29.3 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  28.96 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  27.89 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  30.26 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  26.59 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  34.6 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  22.31 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  33.48 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>