More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1259 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1259  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 
310 aa  631  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.91 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
501 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.08 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  26.81 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  26.67 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  28.43 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  26.35 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  26.35 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  25.08 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14221  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.05 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.05 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.83 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  24.82 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  27.22 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  28.3 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  24.67 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  26.83 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  24.91 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  26.21 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.29 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  27.42 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  26.88 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  26.42 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  27.44 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.7 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  26.77 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  27.53 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  26.3 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  28.15 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1680  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.06 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.178648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
510 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  24.83 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.86 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  27.44 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5321  normal  0.424531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>