113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2466 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 344 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  50 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.29 
 
 		 352 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.09 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  43.82 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  39.94 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  32.69 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  32.78 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.82 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  33.06 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  32.78 
 
 		 341 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  32.78 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  32.5 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  32.39 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  32.39 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.65 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  34.86 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  33.53 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.07 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 336 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  32.54 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  27.2 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  33.05 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.81 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.86 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  35.83 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  27.2 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  33.33 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  30.15 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  30.47 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  33.9 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  27.83 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  25.3 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  25.3 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  25.3 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  25.3 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  26.95 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.07 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.39 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.43 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  24.55 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  28.22 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  25.86 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.29 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  24.1 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  26.99 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  27.67 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  24.64 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  25.93 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  29.82 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  25.14 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  22.77 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  27.37 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>