More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0923 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.41 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  37.44 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  35.61 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  34.31 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  33.64 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  26.44 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  26.44 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  35.44 
 
 		 267 aa  95.5  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  31.75 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.96 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  37.86 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25.96 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  25.48 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.96 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  27.05 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  25 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  30 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.81 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  24.3 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  30.88 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  30.43 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  30.41 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  31.68 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  31.46 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  34.3 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  29.58 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  30.77 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  30.77 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  28.36 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  29.06 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.4 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.1 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  25.5 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 294 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  28.7 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  27.91 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  24.02 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.13 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  23.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  25.65 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  24.88 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  23.9 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  23.58 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  26.92 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  30.39 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  23 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  31.52 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  27.92 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  27.96 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  25.47 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  24.37 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  22.5 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  26.44 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.38 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  23.92 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  29.56 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  36.52 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  30.54 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>