293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1374 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  707    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  81.29 
 
 		 342 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  59.45 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  59.06 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  60 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  60.37 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  56.19 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  55.49 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  53.05 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  52.15 
 
 		 315 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  51.37 
 
 		 344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.98 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  52.42 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  40.56 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  32.22 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  30.37 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.68 
 
 		 294 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  28.21 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.61 
 
 		 294 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  29.92 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  29.48 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.56 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.29 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  26.02 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.2 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  25.48 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  27.95 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  25.98 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.32 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  27.35 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  27 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.1 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.41 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.43 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.27 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  23.85 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.86 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.18 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  27.27 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  23.79 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.82 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.32 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  23.2 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.9 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  27.07 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  30.88 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  33.14 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  33.14 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  28.31 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  22.92 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  28.31 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  25.19 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  26.82 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.74 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  21.93 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  32.39 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.36 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  21.35 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.12 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  21.35 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  28.18 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  26 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  26.1 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  27.27 
 
 		 512 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  29.68 
 
 		 251 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.04 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  27.98 
 
 		 247 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  28.69 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  23.02 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.86 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>