284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2288 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
294 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.73 
 
 
296 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  70.85 
 
 
297 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  70.85 
 
 
297 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  70.85 
 
 
297 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.51 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.83 
 
 
297 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.81 
 
 
297 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  68.81 
 
 
297 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 
293 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.68 
 
 
296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.14 
 
 
295 aa  349  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  59.66 
 
 
303 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.01 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.33 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.93 
 
 
294 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.04 
 
 
292 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.72 
 
 
296 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.05 
 
 
298 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.18 
 
 
295 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
298 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.65 
 
 
292 aa  288  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 
294 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.86 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.17 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
297 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.2 
 
 
301 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.15 
 
 
292 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.48 
 
 
323 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.85 
 
 
299 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 
293 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.8 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.26 
 
 
295 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  46.78 
 
 
295 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  40.47 
 
 
297 aa  230  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  42.45 
 
 
321 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.33 
 
 
321 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.14 
 
 
289 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  40.67 
 
 
301 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  33.33 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  33.11 
 
 
300 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.33 
 
 
310 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
297 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
298 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
307 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 
312 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
303 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
303 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 
295 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
295 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
291 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
287 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  30.52 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.57 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
355 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.66 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.92 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  29.01 
 
 
619 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.69 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
332 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
329 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.11 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.92 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.2 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  25.17 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>