More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1160 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.32 
 
 
286 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.7 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
301 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
291 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
303 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
303 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  38.23 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
295 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
303 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 
295 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
297 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.95 
 
 
297 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
323 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
297 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
298 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
294 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
295 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
287 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  31.65 
 
 
297 aa  136  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
299 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 
301 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
323 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
296 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  31.91 
 
 
316 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.99 
 
 
310 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
292 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  33.12 
 
 
303 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
293 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  30.74 
 
 
301 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
294 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
293 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
311 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
296 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
295 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.1 
 
 
297 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
292 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.1 
 
 
297 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
293 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.23 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
292 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.48 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  26.8 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  27.2 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02090  expressed protein  28.52 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.841584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.12 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.27 
 
 
508 aa  75.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  26.56 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  28.72 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.08 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.55 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  27.3 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  29.05 
 
 
619 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.7 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  28.26 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.07 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  26.52 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>