More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1486 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
298 aa  607  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.12 
 
 
296 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.15 
 
 
295 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.77 
 
 
292 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.39 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  56.12 
 
 
297 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.58 
 
 
301 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.46 
 
 
297 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.24 
 
 
295 aa  292  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.19 
 
 
295 aa  292  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  55.1 
 
 
297 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  55.1 
 
 
297 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.1 
 
 
297 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
294 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.24 
 
 
296 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
302 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.06 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.42 
 
 
297 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.88 
 
 
294 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.08 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.08 
 
 
294 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.95 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.74 
 
 
294 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.23 
 
 
307 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
328 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.48 
 
 
299 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  49.32 
 
 
303 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.66 
 
 
298 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.65 
 
 
296 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.5 
 
 
296 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.5 
 
 
296 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.5 
 
 
296 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 
292 aa  246  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.29 
 
 
293 aa  244  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.62 
 
 
292 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.12 
 
 
298 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.11 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.82 
 
 
323 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.08 
 
 
297 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 
297 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
321 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.64 
 
 
293 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  44.93 
 
 
295 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  41.69 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
311 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  37.97 
 
 
301 aa  189  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  35.03 
 
 
316 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.02 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
298 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
286 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
301 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
295 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  31.19 
 
 
300 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
295 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
312 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
291 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  32.24 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.53 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.9 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  28.3 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.12 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  25.71 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  23.93 
 
 
336 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
324 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02506  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
439 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0777894  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  24.51 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>