More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0427 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 317 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.48 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.06 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.9 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.3 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 317 aa  96.3  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.44 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 193 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.39 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  31.51 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  26.72 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  27.22 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.22 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  27.22 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.67 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  48.61 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  48.61 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.55 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  29.07 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  27.65 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  28.08 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  24.83 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  26.13 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.81 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.74 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  30.85 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  27.46 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  24.58 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  27.08 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.83 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  24.83 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  24.83 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  24.83 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  24.48 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  25.33 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.13 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  24.83 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  48.61 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.48 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  24.75 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  27.11 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>