More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
291 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.15 
 
 
316 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
317 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.17 
 
 
303 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.45 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.87 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.47 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  25.75 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.72 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.69 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
193 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  29.09 
 
 
854 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.15 
 
 
347 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
334 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  24.02 
 
 
241 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
338 aa  55.8  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.54 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  23.21 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
308 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
302 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.52 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  31.37 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.02 
 
 
724 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  31.76 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.33 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.58 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.3 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  29.73 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  32.39 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  30.77 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  25.67 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  26.16 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  28.4 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  25.42 
 
 
341 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.84 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.8 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
227 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  29.83 
 
 
330 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.24 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 
307 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  28.19 
 
 
339 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  25.24 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
358 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  28.95 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  22.4 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.99 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  25.42 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  25.37 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.43 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  25.99 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  25.42 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  25.42 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.838406  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>