More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3033 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  100 
 
 
300 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  58.16 
 
 
321 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.42 
 
 
291 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  55.1 
 
 
291 aa  319  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  54.42 
 
 
291 aa  318  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.8 
 
 
332 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.08 
 
 
328 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  30.77 
 
 
327 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  29.41 
 
 
305 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  29.8 
 
 
297 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.73 
 
 
320 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  27.01 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.58 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.18 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.18 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.69 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  27.27 
 
 
291 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.02 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  30.62 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.24 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  35.08 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  28.1 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.85 
 
 
294 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  32.2 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  26.64 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  30.73 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.81 
 
 
320 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  27.6 
 
 
343 aa  85.9  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  35.71 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  31.03 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 
219 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.6 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.3 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  26.4 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.1 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.42 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  26.62 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
211 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  25.6 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.1 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.8 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  31.17 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.33 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.38 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  23.95 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  29.13 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  27.15 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  28.93 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  25.6 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.73 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  30.27 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  33.18 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  30.29 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  33.55 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  24.7 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  29.61 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  31.03 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  23.24 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
209 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.56 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.43 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.13 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  27.43 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  26.18 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  26.54 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  32.5 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  31.82 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  25.98 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  25.48 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  26.75 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
680 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  27.83 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.41 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  33.33 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.1 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.21 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  32.18 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  32.93 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>