More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6534 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.62 
 
 		 231 aa  356  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.13 
 
 		 231 aa  325  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  60.61 
 
 		 231 aa  286  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  57.39 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  42.33 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  41.88 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  36.32 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  35.68 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  36.62 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  36.24 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  35.05 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.17 
 
 		 282 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.09 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  24.76 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  33.03 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  28.7 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  29.15 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  30.66 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  35.05 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  27.15 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.32 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  23.3 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  25.78 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  24.11 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.97 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.88 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.97 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  26.13 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  29.17 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  32.16 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.94 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 348 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  29.59 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  22.07 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.12 
 
 		 279 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  31.33 
 
 		 854 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  21.82 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.32 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.29 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  29.52 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  23.71 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  26.03 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  24.62 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  32.04 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.82 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.18 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  29.65 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  21.82 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  26.03 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  24.62 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  30.77 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  28.64 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.15 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  25.57 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  25.57 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  28.57 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  22.07 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  21.82 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  27.49 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  21.82 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  28.57 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  27.71 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>