181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2519 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  28.57 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.73 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  28.64 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  28.25 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  27.6 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.3 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  31.43 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.71 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  26.15 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  26.15 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  26.15 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  22.62 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  26.7 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  27.57 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  26.07 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.49 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  27.06 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  25 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  24.88 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  24.07 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  28.07 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  27.01 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  21.78 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  26.44 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  25.12 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  27.01 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  27.01 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  27.01 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  23.47 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  24.39 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  26.82 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  28.37 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  26.44 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  28.57 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  27.84 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  25.69 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  24.15 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  26.49 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  24.06 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  24.77 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  23.64 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  28.35 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  25.78 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  23.7 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.52 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  29.17 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  22.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  24.88 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  23.56 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.14 
 
 		 341 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.14 
 
 		 341 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  24.19 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.51 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44077  predicted protein  27.01 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  23.98 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10896  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  24.86 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  21.21 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.47 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 333 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.95 
 
 		 320 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  25.73 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  27.81 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  24.86 
 
 		 287 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  31.07 
 
 		 486 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  22.17 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>