287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_08621 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
219 aa  440  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  93.61 
 
 
219 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  92.69 
 
 
219 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  79 
 
 
219 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  57.34 
 
 
221 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  55.91 
 
 
227 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  58.26 
 
 
222 aa  258  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  57.34 
 
 
222 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  50.23 
 
 
224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  47.35 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  43.75 
 
 
209 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
219 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 
227 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.62 
 
 
216 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.91 
 
 
218 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
219 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  36.45 
 
 
221 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
232 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  32.24 
 
 
232 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  34.47 
 
 
246 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
232 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  32.41 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.09 
 
 
231 aa  99  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  29.15 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  29.68 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  30.53 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  31.67 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  29.31 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.38 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  30.38 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  28.51 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  26.07 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  28.57 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  28.87 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.89 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  30.25 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28.44 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  33.07 
 
 
126 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  26.57 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  22.93 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  23.36 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.32 
 
 
320 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
270 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  23.36 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.19 
 
 
320 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  23.35 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  24.55 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.86 
 
 
320 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.21 
 
 
320 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  29.14 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.83 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  25.48 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.1 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.1 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.58 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.19 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  25.45 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.53 
 
 
320 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.63 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  25.95 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  23.29 
 
 
215 aa  55.1  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  29.03 
 
 
332 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.57 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.06 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  27.04 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  26.17 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  25.82 
 
 
372 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  26.17 
 
 
276 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.57 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  24.19 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
347 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  24.65 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>