158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0956 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  64.71 
 
 		 227 aa  290  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  55 
 
 		 222 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  54.55 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  55.35 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  56.89 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  49.3 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  50.23 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  52.07 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  50.23 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  42.33 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  41.29 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 227 aa  148  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.93 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  35.16 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  38.31 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.81 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  33.18 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.64 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  33.65 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.7 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  29.28 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  31.73 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  30.13 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.13 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  32.31 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  31.36 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  29.41 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.66 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  27.75 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.54 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  26.5 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28.84 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  30.23 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  27.57 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.73 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.56 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.85 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.08 
 
 		 494 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  38.14 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.37 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  29.91 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.49 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  29.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.54 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.38 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.78 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  27.65 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  29.31 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  25.24 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  25.78 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.38 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  30.05 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  29.25 
 
 		 366 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.59 
 
 		 320 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.03 
 
 		 271 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.08 
 
 		 320 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.63 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  29.17 
 
 		 339 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.7 
 
 		 494 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.09 
 
 		 491 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.31 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.09 
 
 		 491 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>