More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0761 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  100 
 
 		 324 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  99.69 
 
 		 324 aa  666    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  70.94 
 
 		 320 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  65.94 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  65.94 
 
 		 320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  66.88 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  64.26 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  64.58 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  63.95 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  59.06 
 
 		 320 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  51.13 
 
 		 320 aa  338  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  48.26 
 
 		 332 aa  335  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  48.39 
 
 		 339 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  48.04 
 
 		 328 aa  328  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  46.73 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  46.73 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  46.06 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  47.39 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  37.58 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.2 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  24.26 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.33 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.92 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  27.03 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  27.03 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  24.58 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.73 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.05 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  27.07 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  25.68 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  26.58 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  25.81 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.17 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  30.37 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.23 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  26.39 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  23.93 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  24.49 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  23.61 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  26.42 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  27.73 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  25.79 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  27.62 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1032  NmrA family protein  32.31 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.19 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  26.34 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  26.22 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.71 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  26.51 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  24.58 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  27.7 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  23.11 
 
 		 512 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.25 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.85 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.52 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 		 530 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  26.11 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  24.14 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  24.68 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  20.86 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  26.52 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37667  predicted protein  25.1 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.658602  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  33.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  32.73 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  25.65 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  27.5 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>