260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09343 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.6 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.18 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  41.31 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  39.15 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  39.15 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  38.16 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  35.32 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 		 374 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  31.78 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.24 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  32.24 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  32.24 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  31.65 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  33.03 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  26.27 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  39.29 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  28.57 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  34.62 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  31.08 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.22 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.84 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  29.82 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.2 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.41 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.41 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  32.86 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  28.42 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  28.31 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  29.15 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  29.68 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  28.7 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  30.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  30.26 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.94 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.95 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  32.5 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.55 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  27.6 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.13 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.44 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  23.61 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  23.61 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  23.61 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  34.07 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.46 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0355329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  32.43 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>