248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0675 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
223 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.67 
 
 
216 aa  232  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.11 
 
 
230 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  57.42 
 
 
214 aa  215  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.11 
 
 
222 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  47.42 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  52.78 
 
 
229 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.7 
 
 
211 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.61 
 
 
220 aa  161  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
218 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.33 
 
 
218 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  50.47 
 
 
216 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
219 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  42.99 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
212 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 
220 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  43.84 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  42.38 
 
 
214 aa  134  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.4 
 
 
216 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  41.67 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.43 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  49.53 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  37.62 
 
 
218 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
221 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  34.72 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  40.51 
 
 
215 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  37.99 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  30.63 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  30.63 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
211 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
211 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
230 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  41.63 
 
 
374 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.23 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  29.44 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.8 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
213 aa  89  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  29.55 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.9 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.98 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  29.38 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.16 
 
 
310 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.98 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  27.98 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  27.98 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  28.44 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.54 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.33 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.13 
 
 
229 aa  62.4  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.41 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
294 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  25.98 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.22 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  26.54 
 
 
357 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.72 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  25.12 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
309 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  29.19 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.19 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  22.61 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  25.56 
 
 
340 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  32.86 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  22.06 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
291 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.32 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  31.48 
 
 
294 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  27 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  28.21 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>