More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1159 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.72 
 
 		 227 aa  236  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  59.26 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.5 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  56.88 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.33 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.34 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.3 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.3 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.3 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.09 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  56.94 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.35 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.06 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.35 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  45.24 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  49.77 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.62 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  44.02 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  44.65 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.66 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.88 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  36.77 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  38.07 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  38.97 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.65 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  37.67 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  36.57 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  36.28 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.19 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  29.36 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  29.36 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  27.52 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  33.02 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.42 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.51 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  37.8 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  36.79 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  29.36 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  39.63 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.01 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.64 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.16 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.72 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  31.05 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  27.83 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 429 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  26.85 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  29.68 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  28.25 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.68 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  30.7 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  29.68 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  28.25 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  28.25 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  35.59 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.19 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  23.72 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.19 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.67 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 308 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.69 
 
 		 267 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.68 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  31.03 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  33.15 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>