More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4583 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.7 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  42.45 
 
 
312 aa  182  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  39.21 
 
 
308 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  33.88 
 
 
231 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.57 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
219 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.76 
 
 
216 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  33.19 
 
 
221 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
209 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.47 
 
 
209 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  32.92 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
232 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  27 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  27.02 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.02 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  30.13 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  27.61 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  27.61 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.6 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  32.63 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.18 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  30.17 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  29.47 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  30.93 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  29.3 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  32.56 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.01 
 
 
494 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  35.26 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  30.49 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  36.49 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  29.74 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.55 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  28.52 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  32.18 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.64 
 
 
494 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  30.67 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  35.71 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  29.14 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  30.25 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.21 
 
 
223 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  26.99 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  29.41 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  25.27 
 
 
334 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  31.08 
 
 
218 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.37 
 
 
340 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.96 
 
 
491 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.96 
 
 
491 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.93 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  30.41 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  24.35 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  28.15 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  33.54 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  27.33 
 
 
343 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
350 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.52 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  27.43 
 
 
357 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.74 
 
 
210 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.97 
 
 
327 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
212 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  27.85 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  27.22 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.67 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.91 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  23.2 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  26.11 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  28.27 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  28.38 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.69 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.67 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 
223 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>