More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1655 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  73.95 
 
 
218 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.27 
 
 
227 aa  329  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.35 
 
 
219 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  71.36 
 
 
209 aa  314  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.87 
 
 
209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  66.36 
 
 
221 aa  311  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  53.55 
 
 
216 aa  229  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  45.37 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  43.9 
 
 
219 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  43.9 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  37.95 
 
 
227 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  40.76 
 
 
219 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  39.25 
 
 
228 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  40.57 
 
 
222 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  40.09 
 
 
222 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  38.12 
 
 
231 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  39.23 
 
 
221 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
232 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  37.8 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  40.93 
 
 
224 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  36.53 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  35.45 
 
 
232 aa  128  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
234 aa  124  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  34.55 
 
 
231 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  37.13 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  33.03 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.74 
 
 
257 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  32.66 
 
 
257 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  32.66 
 
 
257 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
235 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
238 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 
228 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
225 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  32.73 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
272 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
231 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  33.19 
 
 
282 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
270 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.28 
 
 
321 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
213 aa  92  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.65 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  32.2 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  30.91 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  29.07 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  34 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.03 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  30 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.85 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
301 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  34.23 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  28.76 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  29.52 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  32.85 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  33.12 
 
 
332 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  29.34 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  29.55 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.66 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  33.99 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  33.99 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  26.79 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.13 
 
 
494 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  27.57 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  29.38 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  28.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  29.47 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.17 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  30.41 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  29.58 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  30.46 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.85 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.78 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  30.41 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.53 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.29 
 
 
340 aa  65.1  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  27.62 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  29.53 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  29.53 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  28.32 
 
 
325 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.87 
 
 
320 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>