143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
215 aa  424  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.19 
 
 
218 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.21 
 
 
219 aa  211  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  57.75 
 
 
221 aa  205  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  52.61 
 
 
214 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  57.22 
 
 
215 aa  191  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  54.17 
 
 
219 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.02 
 
 
216 aa  185  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  47.71 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.29 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.22 
 
 
216 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  40.88 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  42.53 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
227 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.51 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
211 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
218 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.44 
 
 
230 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  38.79 
 
 
219 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 
218 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  36.33 
 
 
280 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
219 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
219 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
219 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  37.02 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  34.27 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.94 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  30.52 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
212 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.49 
 
 
220 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.24 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  30.3 
 
 
241 aa  81.6  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
230 aa  81.3  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  28.42 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  29.17 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  35.63 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.37 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.07 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.79 
 
 
320 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.96 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.24 
 
 
320 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  30.1 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.49 
 
 
320 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  33.88 
 
 
374 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  28.67 
 
 
255 aa  58.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.21 
 
 
327 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.78 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.57 
 
 
339 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  34.71 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.76 
 
 
324 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.29 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  27.18 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.09 
 
 
320 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.84 
 
 
320 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.32 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.26 
 
 
291 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  29.61 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  25.91 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  22.82 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  23.64 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  26.67 
 
 
282 aa  51.6  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
294 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.2 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  28.21 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.84 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  25.69 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  31.07 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.04 
 
 
323 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.04 
 
 
323 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  28.21 
 
 
294 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  20 
 
 
320 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  19.02 
 
 
320 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  19.51 
 
 
320 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  24.24 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
306 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.95 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>